ISP ist "In Circuit Programming", als den Kontroller programmieren ohne ihn aus der Schaltung zu nehmen.
Den Arduino programmierst du mittels Bootloader. Um den Bootloader auf einen neuen Kontroller drauf zu bringen brauchst du ISP. Du kannst aber das Programm auch über ISP übertragen und auf den Bootloader verzichten.
Wenn dir das Arduino-Board das bietet was du willst, lohnt es sich nicht. Da ist es besser die Zeit in die Programmierung zu stecken.